MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Selenomonas ruminantium subsp. lactilytica TAM6421 plasmid pSRC2

Total Repeats: 1579

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017076	A	6	6	78	83	100 %	0 %	0 %	0 %	383760554
2	NC_017076	CAA	2	6	198	203	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383760554
3	NC_017076	CAG	2	6	230	235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760554
4	NC_017076	CCT	2	6	249	254	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383760554
5	NC_017076	A	7	7	267	273	100 %	0 %	0 %	0 %	383760554
6	NC_017076	TC	3	6	306	311	0 %	50 %	0 %	50 %	383760554
7	NC_017076	ATTG	2	8	363	370	25 %	50 %	25 %	0 %	383760554
8	NC_017076	CAT	2	6	394	399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760554
9	NC_017076	ATC	3	9	448	456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760554
10	NC_017076	CAGCT	2	10	487	496	20 %	20 %	20 %	40 %	383760554
11	NC_017076	CAT	2	6	516	521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760554
12	NC_017076	CAT	2	6	531	536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760554
13	NC_017076	TA	3	6	568	573	50 %	50 %	0 %	0 %	383760554
14	NC_017076	GCCCG	2	10	583	592	0 %	0 %	40 %	60 %	383760554
15	NC_017076	AAT	2	6	598	603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383760554
16	NC_017076	GCA	2	6	655	660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760554
17	NC_017076	GCT	2	6	735	740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383760554
18	NC_017076	TTC	2	6	748	753	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383760554
19	NC_017076	TGA	2	6	942	947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383760554
20	NC_017076	GGT	2	6	948	953	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383760554
21	NC_017076	CAG	2	6	1067	1072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760555
22	NC_017076	GAA	2	6	1118	1123	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383760555
23	NC_017076	TGA	2	6	1216	1221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383760555
24	NC_017076	A	7	7	1253	1259	100 %	0 %	0 %	0 %	383760555
25	NC_017076	TAC	2	6	1280	1285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760555
26	NC_017076	ATG	2	6	1401	1406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383760555
27	NC_017076	AG	3	6	1500	1505	50 %	0 %	50 %	0 %	383760555
28	NC_017076	GA	3	6	1570	1575	50 %	0 %	50 %	0 %	383760555
29	NC_017076	CAT	2	6	1582	1587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760555
30	NC_017076	TCT	2	6	1629	1634	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383760555
31	NC_017076	TTC	2	6	1667	1672	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383760555
32	NC_017076	ATG	2	6	1686	1691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383760555
33	NC_017076	GTC	2	6	1713	1718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383760555
34	NC_017076	CTTC	2	8	1722	1729	0 %	50 %	0 %	50 %	383760555
35	NC_017076	CTT	2	6	1769	1774	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383760555
36	NC_017076	TGCTCC	2	12	1861	1872	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	383760555
37	NC_017076	CT	3	6	1879	1884	0 %	50 %	0 %	50 %	383760555
38	NC_017076	AAAC	2	8	1978	1985	75 %	0 %	0 %	25 %	383760555
39	NC_017076	GAA	2	6	1999	2004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383760555
40	NC_017076	AC	3	6	2731	2736	50 %	0 %	0 %	50 %	383760556
41	NC_017076	TCTT	2	8	2750	2757	0 %	75 %	0 %	25 %	383760556
42	NC_017076	AG	3	6	2790	2795	50 %	0 %	50 %	0 %	383760556
43	NC_017076	CA	3	6	2826	2831	50 %	0 %	0 %	50 %	383760556
44	NC_017076	TTG	2	6	2852	2857	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383760556
45	NC_017076	ACG	2	6	2876	2881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760556
46	NC_017076	AAAAG	2	10	2941	2950	80 %	0 %	20 %	0 %	383760556
47	NC_017076	GTG	2	6	3029	3034	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383760556
48	NC_017076	TCC	2	6	3095	3100	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383760556
49	NC_017076	GAT	2	6	3117	3122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383760556
50	NC_017076	TATT	2	8	3130	3137	25 %	75 %	0 %	0 %	383760556
51	NC_017076	AGGA	2	8	3146	3153	50 %	0 %	50 %	0 %	383760556
52	NC_017076	CATCTA	2	12	3213	3224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760556
53	NC_017076	TCT	2	6	3298	3303	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383760556
54	NC_017076	CTG	2	6	3347	3352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383760556
55	NC_017076	AC	3	6	3369	3374	50 %	0 %	0 %	50 %	383760556
56	NC_017076	CTT	2	6	3387	3392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383760556
57	NC_017076	CCA	2	6	3425	3430	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383760556
58	NC_017076	AAG	2	6	3511	3516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383760556
59	NC_017076	A	6	6	3586	3591	100 %	0 %	0 %	0 %	383760556
60	NC_017076	GAT	2	6	3607	3612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383760556
61	NC_017076	CAT	2	6	3615	3620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760556
62	NC_017076	ATGTA	2	10	3635	3644	40 %	40 %	20 %	0 %	383760556
63	NC_017076	A	6	6	3667	3672	100 %	0 %	0 %	0 %	383760556
64	NC_017076	TGA	2	6	3756	3761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383760556
65	NC_017076	AGCTCA	2	12	3816	3827	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	383760556
66	NC_017076	TTA	2	6	3858	3863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383760556
67	NC_017076	AGC	2	6	3919	3924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760556
68	NC_017076	A	6	6	3967	3972	100 %	0 %	0 %	0 %	383760556
69	NC_017076	GCAT	2	8	3987	3994	25 %	25 %	25 %	25 %	383760556
70	NC_017076	AAG	2	6	4003	4008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383760556
71	NC_017076	ATT	2	6	4092	4097	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383760556
72	NC_017076	TAT	2	6	4202	4207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383760557
73	NC_017076	ACG	2	6	4219	4224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760557
74	NC_017076	GAA	2	6	4260	4265	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383760557
75	NC_017076	AAG	2	6	4277	4282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383760557
76	NC_017076	CAT	2	6	4283	4288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760557
77	NC_017076	GAA	2	6	4344	4349	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383760557
78	NC_017076	GAAT	2	8	4373	4380	50 %	25 %	25 %	0 %	383760557
79	NC_017076	GAAA	2	8	4391	4398	75 %	0 %	25 %	0 %	383760557
80	NC_017076	GAA	2	6	4422	4427	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383760557
81	NC_017076	A	7	7	4451	4457	100 %	0 %	0 %	0 %	383760557
82	NC_017076	GTT	2	6	4540	4545	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383760558
83	NC_017076	CTA	2	6	4573	4578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760558
84	NC_017076	CAC	2	6	4642	4647	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383760558
85	NC_017076	GCA	2	6	4683	4688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760558
86	NC_017076	TCA	2	6	4738	4743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760558
87	NC_017076	GAAG	2	8	4782	4789	50 %	0 %	50 %	0 %	383760558
88	NC_017076	ACC	2	6	4991	4996	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383760558
89	NC_017076	AAG	2	6	5018	5023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383760558
90	NC_017076	GGCT	2	8	5149	5156	0 %	25 %	50 %	25 %	383760558
91	NC_017076	GAAT	2	8	5203	5210	50 %	25 %	25 %	0 %	383760558
92	NC_017076	CAGGA	2	10	5335	5344	40 %	0 %	40 %	20 %	383760558
93	NC_017076	ATT	2	6	5352	5357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383760558
94	NC_017076	GAAAA	2	10	5430	5439	80 %	0 %	20 %	0 %	383760559
95	NC_017076	A	6	6	5436	5441	100 %	0 %	0 %	0 %	383760559
96	NC_017076	CAG	2	6	5608	5613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760559
97	NC_017076	TCA	2	6	5667	5672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760560
98	NC_017076	GCC	2	6	5724	5729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383760560
99	NC_017076	CGC	2	6	5767	5772	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383760560
100	NC_017076	AGG	3	9	5773	5781	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383760560
101	NC_017076	CTG	2	6	5849	5854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383760560
102	NC_017076	TGA	2	6	5896	5901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383760560
103	NC_017076	TGG	2	6	5911	5916	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383760560
104	NC_017076	GCA	2	6	5946	5951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760560
105	NC_017076	CTAT	2	8	5973	5980	25 %	50 %	0 %	25 %	383760560
106	NC_017076	ATTC	2	8	5995	6002	25 %	50 %	0 %	25 %	383760560
107	NC_017076	ATA	2	6	6098	6103	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383760560
108	NC_017076	ATT	2	6	6191	6196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383760560
109	NC_017076	T	6	6	6198	6203	0 %	100 %	0 %	0 %	383760560
110	NC_017076	CAC	2	6	6290	6295	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383760560
111	NC_017076	TCC	2	6	6339	6344	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383760560
112	NC_017076	CTG	2	6	6364	6369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383760560
113	NC_017076	CAC	2	6	6391	6396	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383760560
114	NC_017076	CT	3	6	6425	6430	0 %	50 %	0 %	50 %	383760560
115	NC_017076	GCC	2	6	6467	6472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383760560
116	NC_017076	GCT	2	6	6473	6478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383760560
117	NC_017076	AAAGC	2	10	6509	6518	60 %	0 %	20 %	20 %	383760560
118	NC_017076	CCA	2	6	6856	6861	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383760561
119	NC_017076	TCAAAA	2	12	6868	6879	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	383760561
120	NC_017076	CAC	2	6	6971	6976	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383760561
121	NC_017076	A	6	6	6981	6986	100 %	0 %	0 %	0 %	383760561
122	NC_017076	GCC	2	6	7089	7094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383760561
123	NC_017076	TGAA	2	8	7122	7129	50 %	25 %	25 %	0 %	383760561
124	NC_017076	CAC	2	6	7133	7138	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383760561
125	NC_017076	CGC	2	6	7213	7218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383760561
126	NC_017076	CCG	2	6	7245	7250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383760561
127	NC_017076	GAAAGC	2	12	7403	7414	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	383760561
128	NC_017076	CCT	2	6	7417	7422	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383760561
129	NC_017076	CAAG	2	8	7450	7457	50 %	0 %	25 %	25 %	383760561
130	NC_017076	ATT	2	6	7464	7469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383760561
131	NC_017076	CGT	2	6	7576	7581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383760561
132	NC_017076	CGAG	2	8	7627	7634	25 %	0 %	50 %	25 %	383760561
133	NC_017076	CAT	2	6	7640	7645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760561
134	NC_017076	GA	3	6	7676	7681	50 %	0 %	50 %	0 %	383760561
135	NC_017076	CGG	2	6	7730	7735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383760561
136	NC_017076	AG	3	6	7740	7745	50 %	0 %	50 %	0 %	383760561
137	NC_017076	TAA	2	6	7750	7755	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383760561
138	NC_017076	TGG	2	6	7804	7809	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383760561
139	NC_017076	AAG	2	6	7932	7937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383760561
140	NC_017076	CAT	2	6	7985	7990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760561
141	NC_017076	GAT	3	9	8003	8011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383760561
142	NC_017076	TGC	2	6	8050	8055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383760561
143	NC_017076	CCAC	2	8	8079	8086	25 %	0 %	0 %	75 %	383760561
144	NC_017076	AAT	2	6	8096	8101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383760561
145	NC_017076	ATC	2	6	8148	8153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760561
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148	NC_017076	ATC	2	6	8345	8350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760562
149	NC_017076	TC	3	6	8349	8354	0 %	50 %	0 %	50 %	383760562
150	NC_017076	ATCC	2	8	8367	8374	25 %	25 %	0 %	50 %	383760562
151	NC_017076	ATC	2	6	8438	8443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760562
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153	NC_017076	TGT	2	6	8704	8709	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383760562
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157	NC_017076	AT	3	6	8880	8885	50 %	50 %	0 %	0 %	383760562
158	NC_017076	TCC	2	6	8907	8912	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383760562
159	NC_017076	CCA	2	6	9067	9072	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383760562
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162	NC_017076	CATC	2	8	9314	9321	25 %	25 %	0 %	50 %	383760562
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169	NC_017076	ATC	2	6	9708	9713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760563
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176	NC_017076	TAT	2	6	9995	10000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383760563
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180	NC_017076	TA	3	6	10373	10378	50 %	50 %	0 %	0 %	383760564
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252	NC_017076	TTC	2	6	14815	14820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383760569
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256	NC_017076	T	8	8	15035	15042	0 %	100 %	0 %	0 %	383760569
257	NC_017076	AAC	2	6	15073	15078	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383760570
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264	NC_017076	CTC	2	6	15449	15454	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383760570
265	NC_017076	TTG	2	6	15510	15515	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383760571
266	NC_017076	GCC	2	6	15548	15553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383760571
267	NC_017076	TTG	2	6	15567	15572	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383760571
268	NC_017076	GCT	2	6	15587	15592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383760571
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399	NC_017076	T	6	6	21952	21957	0 %	100 %	0 %	0 %	383760578
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